到花博會場，不僅可以搭乘免費接駁車、捷運，還能取道藍色公路，甚至是水陸兩用車！為凸顯台北美麗的水岸景致及河川整治成果，市府破天荒將水路納進花博交通運輸計畫內，讓民眾從另一個角度，綜覽大佳園區繽紛花卉，還能感受徐徐微風。
花博「藍色公路」共三條線，串聯起大佳展區對外交通，包括美堤─大佳、錫口─大佳，及大佳遊河線，營運時間自每日早上八點卅分起，至晚間十時卅分止，班距從卅分鐘至一小時不等。票價方面，最低八十，最貴一百五十元，來回票還有折扣。
更有業者看好花博國際宣傳效益驚人，向市府提出「水陸兩用車」營運申請，特別的是，該船由國內業者自主研發，更是全球第一艘以電力驅動的水陸兩用車，展現台灣的「綠色科技」實力。
營運路線從大直美麗華出發，於美堤河濱公園改走基隆河道，終點站為大佳河濱公園，全長約三公里，水陸各半，票價最高上限則為三百五十元。
藉由花博藍色公路營運，結合現有航線，花博交通路網更將擴展至關渡、大稻埕等地，給參觀民眾更多選擇。