英國微生物學家最近研究指出，馬桶蓋的功能絕不只是保持美觀而已，人們上大號完沖廁所時，若沒有蓋上馬桶蓋，糞便中的病原體會衝上空中，造成汙染，容易導致「困難腸梭菌」（C. difficile）等病媒散布，傳染疾病。
里茲大學微生物學家威卡克斯教授等人進行實驗，先把廁所完全殺菌後，再把沾有抗藥性超強的「困難腸梭菌」的馬桶座蓋組，安裝在馬桶上。實驗發現，沖馬桶時，若馬桶蓋沒放下來，困難腸梭菌就會噴到高出座墊25公分左右，即便過了90分鐘，菌數減少，但用儀器依然測得到。
若放下馬桶蓋沖廁所，困難腸梭菌還是由座蓋組的空隙鑽出來，但沖到空氣中的數量會少很多。沒放下馬桶蓋，細菌會噴到水槽、座位的左右兩方與地板，有放下就不會。
威卡克斯等專家指出，許多英國醫院的廁所沒裝馬桶蓋，對於想遏止困難腸梭菌在院內傳播而言，是很大諷刺。
威卡克斯表示，這項研究顯示，使用馬桶蓋有助於避免病原體散布到空中，減少病媒傳播，建議沖馬桶時，一定要把馬桶蓋放下，然後再洗手。