國內爆發疑似禽流感疫情導致日本禁止我國家禽類產品輸入，外界質疑農委會企圖隱匿疫情。農委會澄清，檢驗禽流感病毒的流程約需十九至四十天，十一月中旬二度採樣結果最快明天就可出爐。
雖然疫情尚未確認，但已衝擊國內家禽產業，昨國內家禽市場交易量跌了三成，我方也暫緩核發家禽類產品輸日檢疫證明。農委會國際處副處長蕭柊瓊表示，日本禁止我國家禽類產品輸入，衝擊最大的是鴨肉，到十一月止，我國家禽產品銷往日本的出口額約兩千五百多萬美元，鴨肉占近九成三，約四千七百多噸，雞肉不到四％。
農委會家畜衛生試驗所表示，禽流感病毒檢測標準流程要先採ＰＣＲ（聚合酉每連鎖反應）初步篩檢，約需一到兩天，但因為是觀察病毒「片段」，很容易出現偽陽性，還要進一步做病毒分離、比對病毒ＤＮＡ等才能確認，最快要十九天以上。
防檢局副局長黃國青表示，十一月中第一次採樣結果出爐後，發現有一檢體含禽流感病毒，但試驗的小雞綜合指數偏低，養雞場臨床症狀又不符，無法確認，專家於次日再度採樣。
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