為優先考量國人飲食安全，針對日本輸臺食品，目前嚴格禁止福島等5縣生產製造之所有食品輸臺，對於福島縣外其他地區生產之8大類食品及茶類，持續於我國邊境採取逐批取樣進行輻射檢測，檢測合格始得進口。我國「食品中原子塵或放線能污染安全容許量標準」中，碘131輻射標準為300貝克/公斤，銫134與銫137總和標準為370貝克/公斤，與美、歐盟及CODEX標準相當或甚至更嚴格。
為落實源頭管理，食藥署針對有微量輻射檢出之茶葉品項，特於100年12月增列為逐批查驗品項，並積極與日本進行諮商溝通，強烈要求日本應注意其輸臺茶葉檢出輻射殘留之問題。其後，日本輸臺茶葉輻射檢驗全數合格，檢出件數從102年1月共4件至103年3月有下降情況，同時日本輸臺茶葉輻射檢出值亦有降低趨勢 (44.1Bq/Kg→0 Bq/Kg) ，顯示日方有監控其輸出產品之安全性。
又針對源頭管理之強化，與日本多次諮商後，雙方達成共識，預計於103年5月起展開「台日交流合作計畫」，將針對日本輸臺食品，風險性較高之產品，如活生鮮冷藏水產品、冷凍水產品、乳製品、嬰幼兒食品、茶類、肉品及加工食品等，須檢附日本官方輻射檢測報告，供我國邊境進行檢查及比對，作為後續邊境查驗機率調整之參考，以有效加強源頭管理。
食藥署持續與駐各國代表處保持聯繫，即時掌控各國食品輻射安全情形、輻射管控標準訂定以及各國對日本輸入食品之管控措施等資訊，並進一步評估國內邊境管控措施之合理性及有效性，以確保輸入食品安全與民眾身心健康。