肥胖所帶來的健康問題很多，不論生、心理都可能影響。許多慢性病、心血管疾病常與肥胖有關，而成大醫院近期於國際期刊《國際肥胖雜誌》的發表，指出肥胖可能造成後天的免疫力低下狀況。
成大醫院小兒科教授及臨床醫學研究中心主任謝奇璋教授表示，肥胖患者所產生的可活化免疫系統之促發炎細胞激素產量明顯較健康受試者低，而抑制性細胞激素的產量則有顯著的上升。而在後續的追蹤研究中發現，肥胖患者經過減重手術治療之後，其細胞激素產生不正常的現象可以明顯地得到改善。
謝奇璋教授指出，免疫功能不全可大致分為先天性和後天性的免疫缺損。
國內的後天性免疫缺損，主要來自肥胖以及與肥胖高度相關的第二型糖尿病。臨床上發現糖尿病病患較容易感染肺結核。這類患者遭受感染時，會較一般病患嚴重，治療上比較困難。在顏嘉良博士論文的研究中發現，肥胖發展成第二型糖尿病前，就因為體內的胰島素和脂肪酸濃度過高，影響白血球對微生物刺激的反應已經會造成後天性免疫缺損。
成大醫院家庭醫學部肥胖代謝與營養管理團隊吳至行醫師指出，臨床上也有發現肥胖患者對某些疫苗的反應較差，可能也與肥胖造成的免疫力低下有關。
吳至行教授說，有均衡健康的飲食習慣，不僅可以避免肥胖，也會有健全的免疫系統。因此建議肥胖患者可以到醫院找專科醫師諮詢，控制體重，同時並增進對感染症的抵抗力。