豬流感會不會是廿一世紀第一場流感大流行？國內防疫專家憂心，豬流感病毒是「百變天王」，它在未出現發燒症狀即具傳染力，傳播速度更快，估計半年內全球就會有一波大流行。
國衛院特聘研究員蘇益仁指出，豬流感已有上千人傳染，在墨西哥死亡率近一成，依流行病學推論，已進入「人傳人」階段。目前衛生署已取得一株豬流感病毒株，他認為台灣已有製造疫苗的能力，政府應啟動反轉錄基因製造疫苗程序，對豬流感進入備戰。
蘇益仁認為，現在墨西哥疫情就像第一波小流行，目前全球交通旅遊頻繁，疾病傳播速度恐怕更快，除了以機場發燒篩檢把關，政府應立即啟動疫苗製造，如果台灣現在開始生產疫苗、藥物，最快三到六個月，就能製造出廿萬人的疫苗與藥物。
前衛生署長、中央研究院院士陳建仁分析，豬流感與禽流感最大不同，在於豬流感Ｈ１Ｎ１比較容易變異傳染給人，因為Ｈ１Ｎ１病毒是個「百變天王」，特別容易出現突變株，比禽流感傳給人的機會更高。
目前在墨西哥和美國的感染者，病毒基因定序都相同，但症狀不一。陳建仁分析，墨西哥地區感染者多是年輕人，可能從未接種過流感疫苗，也未感染過豬流感病毒，所以多為重症。美國地區的民眾或許曾接種過疫苗，有交叉保護效力，加上治療藥物普及，因此症狀較輕。
中國醫藥大學附設醫院內科部感染科主任王任賢也認為，新型流感在全球大流行之前，會給人類半年的時間，此時政府一定要盡快研發出疫苗，或向國際採買，做好萬全準備。
面對一觸即發的豬流感疫情，台灣是否會再度陷入當年ＳＡＲＳ來襲的恐慌？陳建仁表示，抗煞當時，醫界並不知道要面對的是何種病毒，而且也無疫苗、藥物防範，當時打的是一場「不知對手是誰」的戰爭，豬流感目前有藥物可治，醫界了解它的弱點，挑戰性不是那麼高。
陳建仁認為，打過流感疫苗的人，可能會有部分保護力，但現在打流感疫苗，似乎緩不濟急。至於是否需使用流感藥物預防？他認為，濫用藥物反而容易造成病毒抗藥性的突變，因此須慎用。