八八救災焦頭爛額之際，新流感疫情警戒線再度拉高，中央流行疫情指揮中心廿四日公布，國內新增兩例Ｈ１Ｎ１新流感死亡病例，累計五例死亡病例中，除了首例有潛在疾病，其他四例都無病史，第五例快篩陽性後即時投藥，仍在短短七天內不治；克流感是否已產生抗藥性，疾管局正深入了解。
疾管局說，至昨天中午，全球新流感死亡病例一七九九例，死亡病例最多的是美國四七七人，南美阿根廷、巴西也是重災區，有三、四百人死亡。
彰化屏東各一名 累計五死亡病例
亞洲地區死亡病例最多是泰國一一一人，其次是馬來西亞、印度、新加坡、菲律賓，台灣五人死亡，超過日本、南韓、香港、越南。
疾管局長郭旭崧表示，第四例死亡病例是彰化縣六歲男童，無特殊病史。他七月十九日出現咳嗽、流鼻水、喉嚨痛、發燒至攝氏卅九度，先至診所求診未改善，次日赴醫院求診並住院治療；七月廿七日病情惡化轉診至中區某醫學中心治療。經過一個月搶救仍不治，八月廿一日宣告死亡。
第五例死亡病例是屏東縣四十四歲女性，非水災受災戶，八月十七日身體不適，廿日發燒至攝氏卅九度等症狀才赴醫院求診，廿一日出現肺炎等症狀，醫院快速篩檢為Ａ型流感陽性，立即給予克流感治療，但仍在昨天凌晨急救無效死亡。
克流感出現抗藥性？ 疾管局調查
郭旭崧表示，這名婦女經快篩後立即投藥，仍無法控制病情惡化，短短一周內即死亡，值得醫界提高警戒。疾管局將深入調查了解，國內是否已出現克流感抗藥性的疑慮。
國內新流感死亡案例不到一個月內快速累積到五人，除了第一例有肝癌、洗腎病史，其他四例都是無任何病史、身體健康的一般人，指揮中心決定近日邀集專家召開死亡病例研討會，探討五例死亡病例為疫情帶來的警訊。
疾管局也將提醒地方衛生單位，加強基層醫療醫師認知，目前已決定放寬用藥，只要出現早期肺炎症狀，即使未經快篩或快篩呈陰性，醫師仍可由臨床症狀判斷給藥，由公務預算支付。
據統計，國內新流感累積重症病例四十三人，五人死亡，五人仍在加護病房救治，廿七人已出院，推估每周感染達上萬人。