許多民眾感染香港腳，都不敢直接用手搽藥，採用棉花棒搽藥。皮膚科醫師說這是錯誤的觀念，用棉花棒搽藥不但浪費，且皮膚角質層沒有充分吸收導致效果也不好，正確塗抹方式應該像搽保養霜一樣，用手輕柔的把藥膏搽到看不見藥膏為止。
新竹署立醫院皮膚科主任黃瑞雲表示，問香港腳或溼疹的病人怎麼搽藥時，許多人會說用棉花棒。當他告訴病人這是錯誤觀念，應該要用手搽藥時，病患會很驚訝地說：「很噁心！」、「這樣不會傳染嗎？」
黃瑞雲說，溼疹(如皮膚炎)和抗黴菌(如香港腳)藥都應用手搽。溼疹不會傳染，香港腳沒想像中易傳染，被傳染的皮膚必須有適合黴菌生長的環境才行。如果覺得噁心不願用手搽香港腳藥膏，可戴上薄手套，即手術用手套來搽藥，不要再用棉花棒了。